一．GS-800基本操作
1．启动仪器
打开仪器开关。仪器开关ON/OFF控制键位于仪器的左边。仪器启动后，电源指示灯点亮。仪器会进行约35秒钟的自检，此过程中准备指示灯会不停闪烁。一旦仪器启动好，扫描灯会开启，电源和准备指示灯会稳定下来。
为得到更好的扫描效果，在电源开启后让仪器进行5分钟的预热。
2．反射性扫描基本步骤：
a)抬起仪器的盖子。
b)把样品扫描面向下放置于图像窗口。
c)使样品沿图像窗口左下方放置。
d)盖上盖子
注意：要缓慢放下盖子，并在其水平置于机身上时打开盖子。
e)扫描的操作和选项，请参见下面关于Quantity One软件操作GS-800部分。
注释：软件中通常把含有反射系数校正条的反射密度值通常作为默认值，所以不需要输入这些值进行校正。要保持图像窗口干净，没有油污和指纹。
3．透射扫描机本步骤：
    A．抬起盖子。
B．把样品扫描面向下放置于图像窗口。
C．放下盖子。
注意：要缓慢放下盖子，并在其水平置于机身上时打开盖子。
D．扫描的操作和选项，请参见下面关于Quantity One软件操作GS-800部分。
 注释：透射梯度表格为操作手册中单独一页。在仪器的右面，也贴有此表格。如果这两个表格都丢失了，请与Bio-Rad联系。要保持图像窗口干净，没有油污和指纹。
二．Quantity One软件操作GS-800进行图像扫描
开始获取图像前，打开File菜单，选择GS-800。仪器的图像获取窗口会打开，显示出一个控制面板和一个扫描窗口。
1．应用选择
可以在Application选项中选择所需参数
A．从Application列表中进行选择
在Step I. Select Application下面点击Select按钮。应用的选项以列表形式从左到右出现。选择所需选项，如果不进行选择，可点击Esc退出。
B．从自己的设置进行选择
如果需要输入自己的设置，可以通过选择进行设置。在Filter旁点击Red，Green，Blue或White，或选择前面三个的任意两个组合（Red-Green，Green-Blue，Red-Blue）。
在Light旁边按钮中选择合适的光源。
选择Reflective来扫描不透明物体，如放置于过滤纸上的干胶，芯片或照片。这种模式的扫描尺寸是30cm×40cm。
选择Transmissive来扫描透明物体，如胶片，胶或幻灯片。这种模式的扫描尺寸是29cm×40cm。
2．扫描区域扫描
A．预览扫描
在对所需区域进行扫描之前，可以对整个扫描区域进行预览以确定样品的确切位置。
点击Preview Scan。在扫描窗口中将出现一个低分辨率的整个扫描区域图像。
B.区域选择
用预览窗口作为指导，在扫描窗口中通过拖动鼠标选择所需区域。所选区域的边界将出现一个框。
注意：所选区域至少1cm宽。
松开鼠标键时，边框将呈现蓝色虚线以提示选择区域。此外还可以通过鼠标在框内拖动来重新定位选择区域；通过鼠标置于边框线上拖动来调整选择区域大小；把鼠标放于框外重新拖动可以重新进行区域选择。
3．分辨率选择
点击Step III. Select Resolutinon下面的Select按钮，打开Select Scan Resolution对话窗口。
A．指定分辨率
如果在Options对话窗口中选择Oversample，那么可在32-169微米范围内指定所需分辨率。可以在主获取窗中的X和Y分辨率中直接输入数值。
B．图像文件大小 
已选择分辨率的扫描文件的尺寸可在Image file size中看到。如果计算机没有足够的空间来保存这一文件，在保存此文件时会出现一个错误信息。这种情况下，需要选择低一些的分辨率或减小扫描区域的尺寸。
4．校准
为保证结果的正确性和可重复性，GS-800可以自动的校正扫描图像的密度。当第一次使用GS-800时，必须选择一些设置来进行正确的校正。在主获取窗中点击Options按钮，打开Densitometer Options对话窗口。
A．透射校正
首先选择主获取窗中的Transmissive检查窗口
然后点击Options按钮。在Densitometer Options对话窗口中，点击Edit Step Tablet按钮，打开Step Tablet Values窗口。
在GS-800仪器外部侧面应贴有关于制造商打印的透射表。
注意：在透射模式下用不正确的透射表数值扫描
图像会引起明显的错误。
首先，在Tablet Serial Number中输入表格的序列号。
Quantity Offset不应用GS-800的透射模式下，这一值为零。
然后在Diffuse列中输入正确的值。然后点击Ok。这些密度值不需要在每次校正时重新输入。
B．反射校正
反射校正推荐使用软件中的默认的值。
浏览或编辑默认的值，首先在主获取窗中选择Reflective检查框，点击Options按钮。在Densitometer Options对话框中，点击Edit Step Tablet按钮。打开Step Tablet Value for GS-800 Reflective对话框。在完成浏览或编辑后，点击OK。
C．其他校正设置
输入表值后，可以点击Densitometer Options对话框中的Calibrate Now按钮开始校正。点击Calibrate Before Every Scan检查框或在Recalibration Interval中指定重新校正的时间间隔。
注意：当改变滤光片或反射或透射设置时，扫描仪将自动进行重新校正。
点击Calibration Report检查框来打印输出仪器的校正报告。
5．获取图像
在扫描前，点击Acquire按钮。扫描图像开始在扫描窗口中逐行出现。
点击Stop按钮可以中断扫描。此时会有一个信息出现，询问是否中断扫描，及是否保存部分扫描结果。
注意：图像将以默认的文件名（包括日期，时间和使用者名字）打开。然而，除非已经选择Auto Save After Scan，文件在选择Save或Save As后得到保存。